Samotnou přípravu ÚKZÚZ na certifikaci dle ISO 9001:2000 realizovala Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně. V následující části projektu ecommerce.cz implementovala řešení Spisové služby (Podatelna, Spisovna), obecné DMS (Document Management System) pro správu dokumentů, aplikaci pro správu Řízené dokumentace a nástroj pro spuštění Workflow nad dokumentem (např. schválení faktury, dovolenky apod.). Dodaná řešení jsou postavena na produktu SystemIdea společnosti ecommerce.cz, který uživatelům umožňuje vytvářet a vkládat dokumenty a zajišťuje jejich další jednoduchou editaci, publikování, správu, předání i archivaci. Společnost AutoCont CZ se na projektu podílela dodávkou hardware, skenovacího pracoviště a také dodávkou produktu IBM FileNet P8.

Většina dokumentů byla před startem projektu v papírové podobě a v této podobě byly také realizovány firemní procesy, jako například vyřízení pošty nebo likvidace faktur. Po zavedení spisové služby je možné tyto procesy převést do elektronické podoby a procesy automatizovat. Zároveň zákazník získal dokumentový systém, kam je možné ukládat dokumenty organizace. Mimo workflow byla realizována i aplikace Řízená dokumentace. Procesem řízené dokumentace je pořizována například tvorba směrnic apod. Dokumenty, u nichž je požadována dlouhodobá archivace, jsou v předem definovaném okamžiku ukládány do elektronického archívu, pro který byl v rámci projektu využit produkt společnosti IBM Filenet P8.