Společnost BONATRANS využívá pro řízení svých logistických a výrobních procesů komponenty švédského informačního systému IFS Aplikace. Řešení, které v roce 2002 implementovala společnost ALTEC, zahrnuje moduly IFS Distribuce, IFS Výroba a IFS Údržba. Součástí dodaného řešení je zajištění kusové evidence výrobků a jejich průběhu výrobou včetně expedice za využití sběru dat pomocí čárových kódů.

Logistické moduly byly původně integrovány s ekonomickým podsystémem aplikace GALILEO. Od ledna roku 2006 nahradil BONATRANS stávající ekonomický podsystém odpovídajícími moduly SAP (CO, FI) a tyto moduly byly úspěšně integrovány s implementovaným řešením IFS Aplikace. Ve světě je již integrace logistických a výrobních modulů IFS Aplikace s ekonomickými moduly SAP běžná, tímto krokem byla poprvé realizována také v ČR.