QNAP Systems uvolnil software pro kompletní správu a instalaci svých NAS serverů. Verze 3.1 tohoto softwaru je zabudována do serverů jako firmware a přichází s řadou nových funkcí včetně podpory virtuálních disků (až 8 virtuálních disků přes SCSI rozhraní), QNAP RAID Recovery pro obnovu zničeného nebo neaktivního RAID pole a v neposlední řadě také s podporou  EXT4 partition pro velmi velké objemy dat.

Firmware 3.1 byl vyvinut s kompletně novým uživatelským rozhraním na bázi AJAXu, které dovoluje snadnější konfiguraci a instalaci těchto zařízení přes webové rozhraní i méně technicky zdatným uživatelům. Nové AJAX rozhraní podporuje oblíbené webové prohlížeče jako je Microsoft Internet Explorer, Safari, FireFox  i Google Chrome. Administrátor má na výběr ze tří barevných schémat, 15 jazyků (čeština bude obsažena koncem srpna) a také QNAP RSS feed pro sledování aktualit a updatů.
Nový firmware je dostupný pro následující modely modely: QNAP TS-119/ TS-219/ TS-219P/ TS-239 Pro / TS-439 Pro / TS-439U / TS-639 Pro / SS-439 Pro / SS-839 Pro/ QNAP TS-509 Pro / TS-809 Pro / TS-809U/ TS-109 / TS-209/ TS-409.